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农业研究院主要任务是研究杂交水稻。提高产量和抗虫抗倒伏的性状。这个刘厚比纺织机知道得稍微多了一点点。当年看到袁隆平事迹时，还百度过杂交水稻的原理，中学生物课也学过孟德斯鸠的遗传学理论。
于是他一股脑将这些理论倒给左慈，让他去传授给一些精于农事的人。研究人员主要是几个老农，意外的是董允作为关心农事的文官，对这件事非常感兴趣，于是刘厚让他做了院长。
火药研究院与火器研究院都是由左慈任院长。刘厚并不满足黑火药，后世那些无烟火药、tnt什么的才是他的终极目标。左慈收了几个有文化的人作研究人员。
而火器研究院主要是研发火枪、火炮和火箭等。主要是由一些铁匠中的佼佼者担任研究员。
机械研究院、造船研究院、飞行研究院和纺织研究院一样都是蒲元兼任院长。
其中机械研究院，刘厚给的任务很多，有水力轮机、新式水车、车床、轴承、新式马车等等，随着刘厚想起什么随时加进去什么。这里集中了大量的木匠和铁匠。
造船学院和飞行学院目前还只是个空壳，除了蒲元这位院长外，就只有一块牌匾，没有一个研究员。
原因很简单，没有相关的人才。造船是东吴的强项，蜀地却没有这方面的人才。飞行更不用说了，如此匪夷所思的事情，刘厚说出来之后，根本没人相信，连宗教界资深人士左慈都认为那只是神仙手段，只存在传说中。哪里能找到擅长制造飞行道具的“人才”？
后来得刘厚解释大家才明白，刘厚要做的不过是“孔明灯”的放大加强版。话说诸葛亮为了传递军情发明了孔明灯，这个大家都知道，毕竟作为刘备集团的工匠，有些工匠还亲自参与了孔明灯的制作，对此熟悉得很。
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